"Freedom" conta a história de um garoto chamado Takeru, que descobrirá um segredo que pode mudar a sociedade em que vive. A civilização na Terra foi destruída e grandes cidades foram construídas no lado escuro da Lua. Declarada como República de Éden, acredita-se ser o único local em que há vida humana. Takeru, assim como outros garotos de sua idade, participa de corridas nas quais utiliza um veículo particular aos habitantes da Lua. Certa vez, seu veículo pega fogo em uma via pública e Takeru é sentenciado a dez horas de trabalho voluntário fora da cúpula onde vive. Nesse momento, descobre fotos e artigos que parecem ter vindo da Terra em meio a fragmentos de um foguete. Sua curiosidade o leva a uma busca pela verdade.