No ano de 2010 d.C., super tornados nasceram ao mesmo tempo em todos os cantos do mundo causando um dano severo. Cinco bilhões de pessoas perderam suas vidas, diminuindo a população mundial para três bilhões. A economia e as forças militares foram dizimados. Países foram congelados embaixo de gelo sólido, planícies afundaram no mar, o mundo mudou dramaticamente. A civilização humana entrou em uma era caótica. A pobreza aflorou nos arredores das zonas econômicas e desempregados se espalharam. A classe que predominava se auto proclamavam Logos e mantiveram sua posição a força. Os pobres eram chamados de Revenus, os quais eram exilados e viviam fora da áreas econômicas especiais. O tempo passou desde então. Katsuragi Jo e Tsurasawa Jin, escaparam de Phantom, uma força organizada para vigiar os Revenus e suprimir elementos renegados dos Logos, levando com eles uma misteriosa garota, Noto Sana. A muitos que estão interessados nela, cada qual com suas próprias razões.
